Koro-sensei est le professeur principal de la classe 3-E du collège Kunugigaoka. C'est une étrange créature qui déclare avoir subitement détruit 70 % de la Lune. Il prévoit ensuite de détruire la Terre en mars de l'année prochaine, mais pour l'empêcher, les élèves de la classe 3-E devront l'assassiner.